Forskare

Du som får tjänsten kommer att arbeta med hur modularitet i värdspecifikt genuttryck utvecklas hos fjärilslarver, genom analys av data från encellstranskriptomik. Du kommer att ingå i en grupp som arbetar i gränslandet mellan evolutionsbiologi, anpassning till värdväxter och encellsgenomik, och du och dina kollegor ansvarar för att analysera befintliga sekvensdata för att jämföra hur celltypsspecifika svar på värdväxter har utvecklats. Arbetet är till stor del beräkningsbaserat och självständigt, och utförs i nära samarbete med övriga medlemmar i gruppen. I dina arbetsuppgifter ingår:

• Att leda den encellstranskriptomiska analysen av befintliga data från två fjärilsarter, till att börja med en kvalitetsbedömning av tillgängliga sekvensdata
• Att placera dessa arter i ett jämförande ramverk tillsammans med befintliga data från andra arter, och undersöka om det är samma celltyper som svarar på olika värdväxter hos olika taxa, eller inte
• Att vid behov validera celltypsbestämningar med in situ-sekvensering
• Att skriva och medförfatta vetenskapliga publikationer samt presentera arbetet vid seminarier och konferenser
• Att dela metoder och kod med gruppen och stötta kollegor och studenter i att ta till sig encellsanalys - kunskapsöverföring är en uttalad del av tjänsten

Alla intresserade sökande uppmuntras att söka, oavsett ålder, nationalitet, kön, funktionsnedsättning, religion eller etnisk bakgrund. Gruppens gemensamma språk är engelska, och goda kunskaper i engelska är därför nödvändiga. För att framgångsrikt utföra de olika arbetsuppgifterna bör den sökande ta egna initiativ, kunna arbeta självständigt samt vara lösningsorienterad och kunna hitta kreativa lösningar på tekniska problem. Vi lägger stor vikt vid personliga egenskaper såsom samarbetsförmåga. Eftersom den sökande kommer att arbeta nära andra i gruppen krävs mycket god kommunikationsförmåga, gott bemötande och pålitlighet.

• Doktorsexamen i evolutionsbiologi, genomik, bioinformatik, molekylärbiologi eller närliggande ämne
• Dokumenterad erfarenhet av att analysera data från encells-RNA-sekvensering, inklusive praktiskt arbete med hela analyskedjan från rådata till annoterade celltyper
• Erfarenhet av att arbeta med icke-modellorganismer, där referensresurser är ofullständiga och annotering inte kan tas för given
• Goda programmeringskunskaper (t.ex. R och/eller Python) och erfarenhet av att arbeta i en högprestandaberäkningsmiljö (HPC)
• Förmåga att arbeta självständigt, planera sitt eget arbete och driva ett projekt framåt
• Dokumenterad förmåga att självständigt driva forskning och publicera vetenskapliga resultat
• Mycket god förmåga att uttrycka sig i tal och skrift på engelska

• Erfarenhet av insekter, särskilt fjärilar (Lepidoptera) eller interaktioner mellan insekter och värdväxter
• Erfarenhet av jämförande transkriptomik mellan arter och av uttrycksevolution hos duplicerade genfamiljer
• Erfarenhet av in situ-sekvensering, spatial transkriptomik eller histologisk validering av transkriptomiska kluster
• Erfarenhet av att undervisa, handleda eller på annat sätt föra över metodkunskap till kollegor

Vi lägger stor vikt vid personlig lämplighet: nyfikenhet, noggrannhet i analysen samt vilja att samarbeta och att förklara sina metoder för andra.